Creado por Julio Pérez Márquez.
julio.pmarquez@uah.es
SeQuencePro es un programa informático de análisis de secuencias de ADN, cDNA y proteínas. Una herramienta dirigida a alumnos y profesores para el aprendizaje y práctica de analisis de la información contenida en las secuencias genéticas. Es igualmente útil en un laboratorio de biología molecular. Es un programa de manejo simple, intuitivo y rápido con cerca de 150 funciones diferentes que se ejecuta en cualquier sistema operativo de Windows.
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Descarga la aplicación (Solo para Windows)
SeQuencePro es un programa informático para el análisis de secuencias de nucleótidos
de ADN de origen genómico, y también para el análisis de proteínas derivadas
de esas secuencias.
Este programa es útil en dos ámbitos de actividad: docente e investigadora. SeQuencePro es una herramienta para la enseñanza práctica de cómo se realiza
el análisis bioinformático de las secuencias genéticas a alumnos que estudian
aspectos de biología molecular o genética en las carreras universitarias
de biología y medicina. Por otro lado es una herramienta de utilidad para
la investigación pues puede ser utilizado por cualquier laboratorio de
biología molecular; el programa extiende su utilidad más allá del ámbito
universitario.
Las principales ventajas y características diferenciales de este programa
son la independencia y la facilidad de uso. El usuario no necesita conectarse
a internet para realizar las rutinas habituales del procesamiento y análisis
de secuencias de ADN o ARN. Aún así, el programa es perfectamente compatible
con las secuencias obtenidas de las bases de datos de genomas de la red,
o que se obtienen en los servicios de secuenciación de ADN. La creación
de un diseño simple ha sido uno de los objetivos en el desarrollo de este
programa. SeQuencePro es un programa de manejo simple, intuitivo y rápido;
el acceso a todas sus funciones se realiza a través de botones localizados
en la pantalla de uso y de esta manera el usuario no necesita buscar aplicaciones
en sistemas de menús y submenús.
SeQuencePro realiza más de 150 funciones diferentes, algunas exclusivas. Las aplicaciones de procesamiento de ácidos nucleicos se agrupan en: edición,
cuantificación, traducción, restricción, generación de oligonucleótidos
o primers, análisis de marcos de lectura, concatenación o contigs y alineamiento
simple de secuencias. Respecto a las secuencias de proteínas, el programa
cuantifica y analiza aminoácidos. Incluye dos bases de datos para almacenar
información de secuencias y oligonucleótidos. Finalmente, el programa contiene
un procesador de texto y un programa de dibujo de vectores y clones.
Publicaciones relacionadas
Unión de Editoriales Universitarias Españolas ISBN 978-84-8138-868-8 (2010)
Perez-Marquez J (2014) SQPrimer: The utility of designing homologous primers
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Perez-Marquez J (2014) SQRestriction: Bio-informatics Sofware for Restriction
Fragment Length Poymorphism of Batches of Sequences.
J Comput Sci Sys Biol 7: 186-192.